Acquisition incrémentale et représentation des systèmes intégrés bactériens par une approche orientée-objet / par Julie Chabalier ; Sous la direction de Gwennaële Fichant et de Cécile Capponi

Bibliogr. p. 125-132

Thèse de doctorat informatique et mathématiques 2004 Aix-Marseille 1

Dans le cadre de l'étude des interactions entre les objets biologiques, nous avons développé ISYMOD, un environnement informatique de représentation, d'acquisition, et d'exploitation des connaissances sur les systèmes intégrés bactériens. Une base de connaissances de domaine modélise les systèmes biologiques, par un ensemble de classes et d'associations, organisées hiérarchiquement. Pour assurer la cohérence globale de la base, nous avons intégré dans le système de représentation, un algorithme de propagation de la classification. L'analyse des systèmes intégrés est représentée au sein d'une base de connaissances méthodologiques extensible, à travers des problèmes décrits et hiérarchisés, des méthodes exécutables, et des stratégies de résolution associant problèmes et méthodes. La co-existence des deux bases dans un même environnement permet un contrôle du flux de données entre les étapes incrémentales d'analyse et de stockage, même en cas d'évolution du schéma des bases